El pueblo de Montijo fue fundado el 29 de junio de 1590 por Pedro Hernández de Cortez, con el nombre de San Pedro de Montijo. A inicios del siglo XX, Montijo se convirtió en un punto de entrada a Veraguas con el establecimiento de Puerto Mutis, que se convirtió en punto de cabotaje entre la provincia de Veraguas y la ciudad de Panamá, ya que al no existir la carretera Interamericana era más rápido y fácil ir por mar que por tierra.
Este puerto también sirvió de base para lanzar expediciones de conquista de las áreas vecinas.
Según el historiador Alfredo Castillero, el origen del nombre se debe a una población española de Badajoz, llamada Montijo.
